Fråga om resor samt checka in bagage

Hej, tänkte boka flyg med flyscanner.se ska flyga inom eu, med sas samt Air Malta, behöver jag checka in bagaget när jag mellanlandar? flyger från kiruna, mellanlandar i stockholm samt amsterdam sen till Malta, sista flygningen med air malta resten med sas.
Kommer ha övervikt i bagaget, måste jag checka in bagaget efter varje destination eller räcker det med att checka in det i Kiruna? 
Mvh